本科自主招生面對的群體是參加高考的畢業生，高職自主招生面對的考生對象比較廣泛，除了高中畢業生，還有中專、職高等學校的學生。

本科自主招生考試難度很高，需要學生在某些方面有特長;高職自主招生考試試題非常簡單，考試的難度也不高。

本科自主招生需要具備某些方面的特長和創新潛質，比如在學科競賽中取得優異成績，或者是有人文社科特長，如果有科技研究創新類的獎項也是可以報考自主招生;有專利發明或者是單科成績非常優秀，報考自主招生也是可以的。

參加高職自主招生的同學，如果考試合格被學校錄取，就不能參加高考了，如果沒有被錄取，還能參加高考，而本科自主招生通過院校測試合格后，還需要參加高考，只不過在高中會降分錄取。

高職自主招生的院校只能在本省招生，但有三所院校除外(長沙民政職業技術學院、北京社會管理職業學院、重慶城市管理職業學院)。而本科自主招生院校有些是面向全國招生，有些是面向本省招生。

廣東省本科自主招生與高職自主招生的區別：

招生對象不同

試點高校自主招生是對現行統一高考招生按分數錄取的一種補充，主要選拔具有學科特長和創新潛質的優秀學生，也就是所謂的"偏才怪才"。

高職自主招生的對象為高級中等教育學校畢業或具有同等學力，身體健康，并已參加2017年高考報名的考生。

招生學校不同

試點高校自主招生2003年啟動，目前招生高校有60所左右，招生人數約占試點高校招生總數的5%，自主招生試點高校中，有些面向全國招生，有些只在本省(市)招生。

而2017年參加本省高職自主招生的院校，都是本省的院校。

報考方式不同

符合試點高校自主報考條件的考生，可向多所高校申請報名，申請學校的數量沒有限制。考生如果材料審核通過，在學校考試時間不沖突的情況下，可參加多所高校組織的考試。

而高職自主招生院校采取不同形式的入學考試評價辦法，考試可采取筆試和面試等形式，考試內容以綜合能力測試為主。各校初試統一時間，譬如廣東今年定于3月4日考試，復試時間自行安排。符合報考條件的考生，每人限報1所院校。

錄取原則不同

獲得高校自主招生認定資格的考生仍要參加高考，在錄取時可享受一定條件的優惠。根據教育部有關規定，入選考生高考總分原則上不應低于考生所在省(自治區、直轄市)有關高校同批次同科類錄取控制分數線。

而高職自主招生院校按照德智體全面衡量、擇優錄取的原則，結合考生高中階段的學習情況及綜合測試成績，自主確定錄取方案。考生參加這些院校自主招生測試合格后可直接被錄取，不用參加當年高考。未被錄取考生可繼續參加當年高考。

報考高職院校自主招生并被錄取的考生，可同時參加高考，參加本科院校錄取，但不能參加高職高專層次的錄取。填報本科院校志愿并被本科院校錄取的考生，取消專科層次錄取資格(含普通專科和高職院校)，即取消高職院校自主招生錄取資格，不得轉回原自主招生錄取院校，也不得參加其他高職高專層次的錄取。