NPDP自下而上的組合管理方法雖然強調從單個項目出發，通過嚴格評估篩選形成項目組合，但在實際應用中存在一些缺點，主要體現在戰略一致性、資源分配、管理復雜度、溝通協調以及創新與長期發展等方面，以下是詳細介紹：

一、戰略一致性挑戰

短期導向：自下而上的方法可能過于關注單個項目的短期潛力和收益，而忽視了項目與組織長期戰略目標的契合度。這可能導致項目組合中的項目雖然各自表現優秀，但整體上無法支持組織實現其長期愿景。

戰略偏離風險：由于缺乏自上而下的戰略指導，項目組合可能逐漸偏離組織的戰略方向，導致資源分散在非核心業務上，削弱組織的競爭力。

二、資源分配不均

資源過度集中：在自下而上的評估過程中，某些具有明顯優勢或潛力的項目可能吸引過多資源，而其他同樣重要但潛力不那么明顯的項目則可能得不到足夠的支持。這種資源分配不均可能導致項目組合的整體效益下降。

資源浪費：如果項目評估標準不夠全面或準確，可能會導致一些實際上并不具備高潛力的項目被選中，從而浪費寶貴的資源。

三、管理復雜度增加

項目數量多：自下而上的方法可能產生大量符合評估標準的項目，導致項目組合中的項目數量過多。這增加了項目管理的復雜度，使得組織難以有效跟蹤和監控每個項目的進展。

協調難度大：在項目數量眾多的情況下，協調不同項目之間的資源分配、進度安排和風險管理變得尤為困難。這可能導致項目之間的沖突和延誤，影響項目組合的整體績效。

四、溝通與協調障礙

部門壁壘：自下而上的方法可能加劇部門之間的壁壘，因為每個部門都可能傾向于推動自己項目的進展，而忽視與其他部門的協作和溝通。這可能導致項目之間的信息孤島和重復工作，降低組織效率。

溝通成本高：為了確保項目組合與組織戰略的一致性，需要加強跨部門和跨項目的溝通與協調。然而，這往往需要投入大量的時間和精力，增加了組織的溝通成本。

五、創新與長期發展受限

創新項目忽視：在自下而上的評估過程中，一些具有創新性和高風險性的項目可能因為短期內無法看到明顯收益而被忽視。然而，這些項目可能對組織的長期發展具有重要意義。

長期發展不足：由于過于關注短期潛力和收益，自下而上的方法可能導致組織在長期發展方面投入不足。這可能使組織在面對市場變化和競爭挑戰時缺乏足夠的靈活性和適應能力。