考生在吉林省教育考試院官網免考課程申請系統中完成信息填報并上傳相關材料后提交系統審核，經考生所在縣(市、區)教育考試機構審核通過后，提交市(州)教育考試機構審核，市(州)教育考試機構審核后提交省教育考試院審核。省教育考試院審核合格后，成績由省教育考試院統一歸檔并發布，考生可在申請系統中查詢結果。

通過學歷證書申請免考課程的考生，網上申請時學歷證書經系統在線學歷審核通過的，不需要上傳畢業證書。經系統初審未通過的考生，可以選擇“其它情況免考課程”進行申請，除要求上傳相關學歷證明材料外，還需要上傳一份考生本人手寫并簽字的情況說明材料。

2001年(含2001年)以前的畢業證書需要上傳學歷認證報告(通過中國高等教育學生信息網網上申請);2002年(含2002年)以后取得的畢業證書(含普通高校、成人函授、網絡教育、自學考試)需要提交《教育部學歷證書電子注冊備案表》。畢業證書上的個人信息(姓名、出生日期等)和本人現在身份信息不符的，需上傳公安部門出具的戶籍證明原件、戶口本原件;如果是由于畢業院校工作失誤造成的，須上傳畢業學校出具相關證明材料。同時，網上申請時，還需要上傳由原畢業學校教務部門出具包括課程名稱、學分或學時、考試成績的學籍登記表原件照片。

通過全國英語等級考試成績通知單或合格證申請免考課程的考生，需要上傳相關材料,并在證件上方清晰標明取得成績單或合格證的省份。通過全國計算機等級考試證書申請免考課程的考生，需要考生提交原件照片;

在吉林省本科高校和高職高專學校報考的在校生，申請免考課程辦法與社會考生相同，在籍考生考籍信息和畢業信息具有同等效力，在校考生的成績單由學校統一審核，不需要考生上傳到系統。申請完成后由學校統一上報吉林省自學考試在校生(二學歷、高職高專)免考申請審核表(見附件)。申請表需要院校相關部門負責人簽字蓋章后上報市(州)教育考試機構，市(州)教育考試機構負責人簽字蓋章后上報省教育考試院自考部。