2.鹵素：F、Cl、Br、I，強吸電子基，可增加脂溶性，還會改變分子的電子分布，增強與受體的電性結合，使生物活性發生變化。

如吩噻嗪類2位引入三氟甲基（-CF3）得到氟奮乃靜。

如醋酸氟代氫化可的松抗炎作用比醋酸氫化可的松強。

注意：存在即合理。后續出現的藥物，必然存在老藥不具備的特點。或者療效更佳，或者安全性更好，或者更穩定等。

3.羥基（－OH，脫胎于H2O）和巰基（－SH）：可增加藥物分子的水溶性，還可與受體發生氫鍵結合，增強與受體的結合力，改變生物活性。

4.醚（-O-）和硫醚（-S-）：醚類結構中的氧具有親水性，但烷烴基具有親脂性，易于通過生物膜，有利于藥物的轉運。具體情況具體分析。

硫醚易被氧化成亞砜（S＝O）或砜（O＝S＝O）。

風流黃：有硫，可成亞砜或砜，磺。

5.磺酸（－SO3H）、羧酸（－COOH）和酯（－COO－）：酸在堿性條件下成鹽，增加水溶性和解離度。但酯增加脂溶性。

抗腫瘤藥巰嘌呤難溶于水，引入磺酸基后可制成鈉鹽得到磺巰嘌呤鈉，增加藥物的水溶性。

頭孢呋辛極性較大，不能口服，只能通過注射給藥，使用不方便。將頭孢呋辛的羧基酯化得到前藥頭孢呋辛酯，脂溶性增強，可口服，吸收良好。

6.含氮原子類：多呈堿性，活性伯胺＞仲胺＞叔胺。

季銨（金戈鐵馬）水溶性大，不易通過生物膜和血腦屏障，吸收不佳。但可用于穿透細菌的細胞壁，如四代頭孢。