高新技術企業增值稅加計扣除5%是指符合條件的高新技術企業在計算增值稅應納稅額時，可以按照當期可抵扣進項稅額的5%進行加計扣除。這一政策旨在減輕企業稅負，鼓勵技術創新和研發投入。

一、政策依據

1、政策依據：《財政部 稅務總局 科技部關于提高研究開發費用稅前加計扣除比例的通知》（財稅〔2018〕99號）等相關文件。

二、政策內容

1、適用對象：高新技術企業中的制造業一般納稅人。這里的“高新技術企業”是指按照相關規定認定的高新技術企業，包括其所屬的非法人分支機構。

2、抵減比例：允許高新技術企業按照當期可抵扣進項稅額加計5%抵減應納增值稅稅額。

3、時間范圍：該政策自2023年1月1日起實施，至2027年12月31日止。

三、具體計算方法

1、計提基數：當期可抵扣進項稅額。

2、計提比例：5%。

3、抵減方式：高新技術企業按照現行規定計算一般計稅方法下的應納稅額后，根據抵減前的應納稅額與當期可抵減加計抵減額的大小關系進行抵減。具體情形包括：

（1）抵減前的應納稅額等于零的，當期可抵減加計抵減額全部結轉下期抵減。

（2）抵減前的應納稅額大于零，且大于當期可抵減加計抵減額的，當期可抵減加計抵減額全額從抵減前的應納稅額中抵減。

（3）抵減前的應納稅額大于零，且小于或等于當期可抵減加計抵減額的，以當期可抵減加計抵減額抵減應納稅額至零；未抵減完的當期可抵減加計抵減額，結轉下期繼續抵減。

四、注意事項

1、出口貨物與跨境應稅行為：高新技術企業出口貨物勞務、發生跨境應稅行為不適用加計抵減政策。若兼營出口且無法劃分，則按銷售額的比例確定不能加計抵減的進項稅額。

2、政策選擇：若高新技術企業同時符合多項增值稅加計抵減政策，應選擇最有利于自身的政策適用，但不能疊加適用。

3、單獨核算：高新技術企業應單獨核算加計抵減額的計提、抵減、調減、結余等變動情況。

綜上所述，高新技術企業增值稅加計扣除5%是國家為鼓勵技術創新推出的稅收優惠政策，企業需滿足條件并按規定操作，以享受政策紅利。