在行政訴訟程序中，管轄權爭議的解決機制通過法定程序保障訴訟參與人的合法權益，確保案件審理的合法性與公正性。現行法律體系構建了雙重程序路徑以應對管轄權爭議：一是訴訟參與人針對管轄權提出的異議程序，二是基于行政機關權限不足的管轄權變更申請程序。

針對管轄權異議程序，當行政機關主張對案件具有管轄權時，訴訟參與人可依法提出質疑。根據《行政訴訟法》及相關司法解釋，異議提出方須在收到管轄權通知之日起15日內，向受理機關提交書面異議申請，并附具事實依據與法律依據。受理機關應在收到異議申請后10日內完成審查并作出書面答復。若經審查仍維持原管轄決定，異議方有權自收到答復之日起15日內向有管轄權的人民法院提起管轄權異議之訴，由司法機關對管轄權歸屬作出終局裁判。

在管轄權變更申請程序中，當行政機關認為自身不具備案件處理權限時，當事人可基于程序正當性原則申請調整管轄單位。此類申請須在提交行政起訴狀前提出，并附具管轄權不成立的初步證據材料。行政機關應在收到申請后15日內完成審查：若同意變更管轄，須制作書面決定并附全案卷宗移送至有管轄權的機關；若駁回申請，應書面說明理由并告知救濟途徑。當事人對駁回決定不服的，可自收到決定之日起15日內向人民法院提起管轄權確認之訴，通過司法審查維護程序權利。

上述程序設置嚴格遵循"有權利必有救濟"的法治原則，通過明確異議期限、審查標準及救濟渠道，構建起完整的管轄權爭議解決閉環。其制度價值體現在三個方面：一是保障訴訟參與人的程序參與權，避免因管轄錯誤導致訴訟資源浪費；二是強化行政訴訟的程序正當性，通過司法最終裁決原則維護法治統一；三是提升司法透明度，使管轄權爭議的解決過程成為彰顯程序公正的重要載體。這種制度設計最終服務于"讓人民群眾在每一個司法案件中感受到公平正義"的法治目標。